Springのコンテキストファイルにjdbc:embedded-databaseタグで
type="H2"でbeanを登録します。

jdbc:scriptタグで初期化時に実行したいSQLファイルを指定できます。
Sprintって、本当に便利ですね。

<jdbc:embedded-database id="dataSource" type="H2">
    <jdbc:script location="classpath:schema.sql"/>
    <jdbc:script location="classpath:test-data.sql"/>
</jdbc:embedded-database>

ちなみにjdbcのnamespaceの登録も忘れずに。

xmlns:jdbc="http://www.springframework.org/schema/jdbc"
xsi:schemaLocation="http://www.springframework.org/schema/jdbc
        http://www.springframework.org/schema/jdbc/spring-jdbc-3.0.xsd">

H2以外でもHSQL、Derbyがサポートされています。